L’équipe de BioStIn-E​

Les coordinateurs :

Marie-Hélène Le Du

Directrice de Recherche du CEA à l’I2BC, Gif-sur-Yvette

Expertise scientifique : Biologie structurale, cristallographie, diffusion des rayons X aux petits angles, Architecture des télomères
Autres centres d’intérêt : Pédagogie multimédia : MOOC, Jeux sérieux, livre,…
Coordinatrice du MOOC « Voyage au coeur du vivant avec des rayons X : la cristallographie« 

Vidéos :
1/ Qu’est-ce qu’une structure 3D
2/ Les méthodes de biologie structurale
3/ Les prérequis : connaitre son échantillon
4/ Clonage, production, purification des échantillons
5/ Les caractéristiques d’un cristal et la loi de Bragg
6/ Interaction lumière / matière
7/ Introduction à la transformée de Fourier
8/ La transformée de Fourier et le problème des phases
9/ La fonction de Patterson
10/ Affinement, interprétation et évaluation du modèle
11/ Vidéo d’animation : Voyage dans l’univers des protéines

Robert Schneider

Chercheur du CEA à l’IBS, Grenoble

Expertise scientifique : Biologie structurale, spectroscopie RMN, biophysique, protéines membranaires, protéines désordonnées
Autres centres d’intérêt : Pédagogie multimédia : MOOC,…
Equipe pédagogique du MOOC Nuclear Magnetic Resonance a Compass to Nanoword

Vidéos :
1/ Histoire de la RMN
2/ Le champs magnétique local
3/ Le déplacement chimique
4/ L’instrument RMN
5/ L’expérience RMN 2D

Pierre-Damien Coureux

Professeur à l’Université Claude Bernard Lyon 1

Expertise scientifique : Biologie structurale, Cryo microscopie électronique, cristallographie aux rayons X, régulation de la traduction
Autres centres d’intérêt : e-learning, enseignement

Vidéos :

L’équipe complète, par ordre alphabétique :

Karine Blondeau

Maitre de conférences à l’Université PARIS-SACLAY
Directrice du service de Formation Continue & VAE de la Faculté des Sciences d’Orsay
Chercheur à l’Institut de Biologie Intégrative de la cellule  I2BC
Responsable de la plateforme de prestation de services de recherche Prot-Ex

Expertise scientifique : Biotechnologie microbienne, Microbiologie industrielle, Production de protéines recombinantes
Autres centres d’intérêt : Reprise d’études, Validation des acquis, DAEU, Formation continue


Vidéos : La préparation des échantillons biologiques :
1/ Quel système d’expression pour quel projet ?
2/ Choisir concrètement son système d’expression

Jean-Baptiste Charbonnier

Directeur de Recherche du CEA à l’I2BC, Gif-sur-Yvette

Expertise scientifique : Biochimie des protéines, Interactions des macromolécules, Biologie Structurale, Réparation de l’ADN
Autres centres d’intérêt : Enseignement


Vidéos :
1/ Ces mutations qui rendent malades
2/ Cristallisation : Principes généraux
3/ Cristallisation : Approches, plateformes
4/ Cristallisation : Visite du laboratoire

Sonia Fieulaine

Chercheuse du CNRS à l’I2BC, Gif-sur-Yvette

Expertise scientifique : Biochimie, Biologie Structurale, Traduction in vitro, Virus à ARN positif

Vidéos :
Production de protéines in vitro

Dominique Housset

Chercheur du CEA à l’IBS, Grenoble

Expertise scientifique : Cristallographie, Diffraction électronique, Biologie Structurale, Biophysique
Autres centres d’intérêt : Enseignement

Vidéos : Coefficient de corrélation :
1/ Définition
2/ Applications

Bruno Kieffer

Professeur à l’École Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg

Expertise scientifique : RMN, Biologie Structurale
Autres centres d’intérêt : Enseignement

Vidéos : Introduction à la RMN
1/ Première partie
2/ Deuxième partie

Pierre Legrand

Responsable de ligne sur PROXIMA1, ligne dédiée à la cristallographie du synchrotron SOLEIL, Saint Aubin

Expertise scientifique : Cristallographie, Cryo-EM, Biologie Structurale.
Équipe pédagogique du MOOC « Voyage au coeur du vivent avec des Rayons X : la cristallographie

Vidéos :
1/ Le traitement des données de diffraction
2/ L’analyse des données de diffraction

Yves Méchulam

Directeur de Recherche du CNRS au Bioc
Professeur à l’école Polytechnique, Palaiseau

Expertise scientifique : Cristallographie, Cryo-Microscopie Électronique, Biochimie, Mécanismes de traduction des ARNm en protéines
Autres centres d’intérêt : Enseignement
Équipe pédagogique du MOOC « Voyage au coeur du vivent avec des Rayons X : la cristallographie

Vidéos :
1/ Phasage expérimental : Le remplacement isomorphe
2/ Phasage expérimental : La diffusion anomale
3/ Le remplacement moléculaire
4/ Amélioration des phases et construction du modèle

Célia Plisson-Chastang

Directrice de Recherche du CNRS au MCD-CBI, Toulouse

Expertise scientifique : Biochimie, Biologie structurale, Cryo-Microscopie Électronique, Etude des ribosomes
Autres centres d’intérêt : Enseignement

Vidéos : Introduction à la Cryo-EM couplée à l’analyse d’images :
Première partie
Deuxième partie

Sylvain Ravy

Directeur de Recherche du CNRS au Laboratoire de Physique des Solides de l’Université Paris-Saclay, Orsay

Expertise scientifique : Cristallographie, Systèmes Désordonnés, Diffusion des Rayons X
Autres centres d’intérêt : Vulgarisation Scientifique, Histoire des Sciences
Équipe pédagogique du MOOC « Voyage au coeur du vivent avec des Rayons X : la cristallographie« 

Vidéos :
1/ Histoire de la cristallographie aux rayons X : les débuts
2/ Histoire de la cristallographie aux rayons X : la suite
3/ Le rôle du CCP4

Bruno Robert

Directeur de Recherche du CEA à l’I2BC, Gif-sur-Yvette

Expertise scientifique : Photosynthèse, Spectroscopie, États électroniques excités
Autres centres d’intérêt : Infrastructures en Biologie Santé Agronomie

Vidéos : De la photosynthèse aux bioénergies :
1/ La photosynthèse
2/ Vers les bioénergies

Alain Roussel

Directeur de Recherche du CNRS, Marseille

Expertise scientifique : Cristallographie, Biologie structurale

Vidéos :
Petite histoire de l’informatique
Introduction à LINUX

Guy Schoen

Directeur de Recherche du CNRS
Responsable du groupe Microscopie électonique et léthodes de la plateforme de ME de l’IBS, Grenoble

Expertise scientifique : Cryo-mircoscopie électronique, haute résolution, structure 3D, complexe macro-méculaire biologique
Autres centres d’intérêt : virus, instrumentation, plateforme technologique

Vidéo : La cryo-microscopie électronique en biologie structurale

Serena Sirigu

Scientifique de ligne sur PROXIMA2A, ligne dédiée à la cristallographie du synchrotron SOLEIL, Saint Aubin

Expertise scientifique : Cristallographie, Biologie Structurale.
Équipe pédagogique du MOOC « Voyage au coeur du vivent avec des Rayons X : la cristallographie

Vidéos :
1/ Comment générer des rayons X
2/ La congélation des cristaux
3/ L’environnement du cristal dans la cabane expérimentale
4/ Acquisition des données : la stratégie de collecte

Gerlind Sulzenbacher

Ingénieure de Recherche du CNRS à l’AFMB, Marseille

Expertise scientifique : Cristallographie, Biologie structurale, Glycobiologie
Autres centres d’intérêt : Diffusion de la culture scientifique

Vidéos : Modèles structuraux :
1/ Comment les observer
2/ Évaluer la qualité d’un modèle

Carine Tellier-Lebègue

Technicienne du CEA à l’I2BC, Gif-sur-Yvette

Expertise scientifique : Biochimie des protéines, Expression et purification de protéines recombinantes, Préparation d’échantillons complexes protéines/ARN.

Vidéos :
Cristallisation : 1/ Principes généraux
2/ Approches, plateformes
3/ Visite du laboratoire : la cristallisation
4/ Visite du laboratoire : La préparation des échantillons

Aurélien Thureau

Scientifique de ligne sur SWING, ligne SAXS du synchrotron SOLEIL, Saint-Aubin

Expertise scientifique : SAXS, Biologie Structurale, RMN, Modélisation moléculaire

Vidéo : Introduction à la diffusion des rayons X aux petits angles

Sophie Zinn-Justin

Directrice de Recherche du CEA à l’I2BC, Gif-sur-Yvette

Expertise scientifique : RMN, Interactions des macromolécules, Biologie Structurale, Réparation de l’ADN
Autres centres d’intérêt : Formation (master/thèse,découverte de la recherche)

Vidéos : Ces mutations qui rendent malades

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